德祐二年（1276年）三月，蒙古大軍攻佔了南宋都城臨安（今杭州），俘虜了5歲的南宋皇帝恭帝以及謝太后，南宋王朝事實上已經滅亡。陸秀夫、文天祥、張世傑等南宋大臣不甘心就此亡國，在福州擁立宋度宗的庶長子趙昰為皇帝（史稱宋端宗）成立南宋小朝廷。同年十一月元軍自浙江入福建，為避元軍強盛的兵鋒，張世傑、陸秀夫帶著宋端宗率領舟師十萬餘人由福州航海自泉州港「欲作都泉州」，欲以泉州為根據地繼續抗元，力圖恢復宋朝。

而世受南宋皇恩的泉州市舶司蒲壽庚（祖籍西域阿拉伯人）此時早已暗通元朝，對南逃的宋端宗、張世傑、陸秀夫等一行人「閉門不納」。張世傑無奈只得護送宋端宗繼續南逃，臨行前強行將蒲壽庚家族停在港口的數百條商船及船上的貨物全部徵收，「掠其舟並沒其貲」。蒲壽庚由此大怒，竟然將在泉州的南宋皇族宗室子弟全部屠殺，多達三千餘人。此外，在泉州的士大夫以及南避的淮兵也遭到了屠殺，更是不可計數，然後將泉州獻於元庭，並且積極派兵協助元軍南下追殺南逃的宋端宗、宋末帝二帝。

泉州的許氏家族不滿蒲壽庚叛國投元，起義兵抗擊蒲壽庚以掩護宋端宗等人南逃，而被蒲壽庚滅族。泉州清源少林寺反抗蒲壽庚降元，亦遭到蒲壽庚和元將奇握溫思的聯合鎮壓，他們率元軍萬人衝進少林寺大肆屠殺僧侶，千餘僧眾被屠殺，只有數十人得以逃出。

通過對南宋義軍的殘酷無恥的屠殺，蒲壽庚成為元庭的忠實走狗，得到了元朝的賞識和重用。至元十五年（1278年），蒲壽庚被元朝任命福建行省中書左丞，終元代一朝，蒲壽庚家族始終掌控海上的貿易，獨霸市舶。南宋滅亡後，蒲壽庚家族繼續扮演著泉州土皇帝的角色，蒲壽庚家族勢力及財富比以往更加強盛。

到了元末，天下各地起義軍突起又開始大亂。蒲壽庚家族以為元朝將要滅亡，又故伎重演，勾結當時的提舉泉州市舶使色目人那兀納（蒲壽庚的孫婿）舉兵叛亂。但這次蒲壽庚家族再也沒有宋末那麼幸運了，蒲氏家族的叛亂最終被元朝大將陳宗海強力鎮壓。元至正二十六年（1366年）五月陳宗海率領水陸兩路元軍攻入泉州，並對以蒲氏家族為首的色目人展開大規模的屠殺，蒲氏家族幾乎被滅族，蒲壽庚、蒲師文等人則被掘墳戮屍。「是役也，凡西域人盡殲之，胡發高鼻有誤殺者，閉門行誅三日。」「凡蒲屍皆裸體，面西方……悉令具五刑而誅之，棄其胾於豬槽中」，極盡侮辱之能事。

而且，蒲氏家族的噩運並沒有隨著元朝的滅亡而告終，明朝建立以後，明太祖朱元璋對世受國恩卻賣主求榮反覆無常的蒲氏家族深惡痛絕，下旨特令將泉州的蒲壽庚這一脈的蒲氏舉族全部打入賤籍，男的發配充軍，女的為娼妓，世代為奴不得入仕。

「洪武七年，高皇帝大赦天下，聖旨：獨蒲氏餘孽悉配戎伍，禁錮，世世無得登仕籍，監其禍也。」。經過明太祖朱元璋這番打壓，蒲姓受到打壓，遷往各地的蒲姓紛紛改姓。